全新的雙層平行光路設計，打破以往的單層光路，使Ni系列可以同時加裝CCD影像裝置和高階系統組件如雙層螢光濾片轉盤、Photoactivation module、multiphoton detector (NDD)，使得可應用的層面更加靈活與寬廣，如:FRAP、Multi-color fluorescent等。
高速電動excitation/barrier filter轉盤模組
搭配高速電動barrier filter wheel (7 孔, 轉速0.2sec.)及電動excitation filter wheel (8 孔, 轉速0.15sec.)，使得Multi-color fluorescent得以實現，同時也可進行FISH及Signal conversion等實驗
螢光模組及Photoactivation模組的組合
雙層光路的設計，使得Ni可以實現同時裝上螢光模組以及Photoactivation模組，這是屬於正立顯微鏡的一大進步和突破
雙光子影像擷取，提供更深層的影像資料
透過與Nikon A1R Multiphoton 系統的組合，及高感度的NDD(non-descanned detector)，
使得Ni可以擷取樣品更深層以及更清晰的影像，另外透過改變對焦系統由載物台變成鼻輪調整焦距，使載物台可以固定位置，可以方便進行in vivo 的實驗，這也是Ni有別以往的全新設計。
更強的電動化模組以及人性化的操作介面
透過設定，可以輕鬆地在改變物鏡後自動調整光圈大小、濾片，同時也可透過設定來預設不同觀察模式，輕鬆轉換明視野、DIC、相位差及螢光觀察等觀察方式。
Fly-Eye Lens設計，讓穿透光光源能更平均的散落在樣本上面，使得影像能夠有更均勻的呈現。
螢光濾片躁訊消除設計，使得螢光觀察法可以獲得更高的Signal/Noise，並得到更加專一的螢光訊號。
